Nat Biotechnol :深度解读!科学家成功清楚地插图出人类肠道的微生态系统目录!

2021-12-13 00:04:32 来源:
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亦同,一项刊发在国际性杂志Nature Biotechnology上题为“A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome”的研究成果报告之前,来自欧洲分子生物科学实验室等私人机构的研究小组们通过研究成果将有本机胃细菌四组之前所有未知的酵母菌基因四组编订成了一个大型的索引,从而就能协助研究成果技术人员深入即使酵母菌基因和蛋白彼此之间的相似之处,以及其对有本机身体健康的不良影响。

酵母菌密布体内内外,其能够产生酵素来不良影响本机消化、身体健康和对疾病的易感性,其如此普遍以至于体内细菌四组成员的数量要人中体细胞还要多,包括酵母菌、真菌和其它细菌;为了理解酵母菌在有本机生物科学之前所扮演的关键脚色,研究小组们通常会在实验室之前分开并对其培植,随后在对酵母菌展开DNA分子生物学,然而现今很多酵母菌还无法在实验室的状况之前被培植繁殖。

为了给予这些酵母菌的具体的资讯,研究成果技术人员采取了另外一种步骤,他们从状况之前(比如胃)收集基本上样本,随后在对整个样本之前的DNA展开分子生物学,然后利用计算机步骤对来自基本上样本之前的数千种物种的生物体基因四组展开重建,这种步骤被称之为裕基因四组学技术,该技术能作为一种替代步骤对单个物种的DNA展开分开和分子生物学。

研究成果者Rob Finn指出,去年包括我们在内的三个独立制作组重建了在在个胃细菌四组基因四组,而远超过的问题就是这些制作组所得到的结果确实具有可比性,以及确实能将这些结果编订成为一个比较全面的表单。现今研究成果技术人员已经从有本机胃之前少于4600种酵母菌繁殖地之前编订了20万个基因四组和1.7亿个酵素序列,这种新型的索引(统合的有本机中枢神经基因四组集合和统合的中枢神经酵素第一版)概述了本机胃的巨大多样性,并为进一步展开胃细菌四组研究成果铺平了道路。

研究成果者绘制出的这个巨大的第一版是细菌四组研究成果的一个开端,未来或将能为研究小组们提供比较宝贵的天然资源来研究成果有本机胃生态系统之前每一种酵母菌所扮演的关键脚色。这项研究成果指出,少于70%被检测到的酵母菌从而在实验室之前被成功培植过,而其在体内的活性依然确实,而这类酵母菌之前远超过的群体就是Comantemales;研究成果者指出,看到Comantemales如此广泛敢说一个欢笑,这就更为重要了我们的确对胃之前的酵母菌知之甚少,我渴望这个第一版能协助生物的资讯学家和分子生物研究小组在未来几年弥补这一知识空白。

该索引/第一版收集的所有数据都能在在线天然资源Mgnify之前给予,其能协助研究小组们分析细菌的基因四组数据并且与当前的索引展开对比;随着世界各地研究成果制作组不断发布原先索引,该第一版可能会扩展到到包括其它本机臀部的细菌四组,比如皮肤或食道内部等臀部。最后研究成果者指出,这一第一版的编订未来或为酵母菌学和流行病学成果技术人员提供丰富的天然资源,然而研究成果技术人员可能会在南美洲、亚洲和美洲等民族特色太低的地区见到越来越多原先酵母菌物种,现今研究成果技术人员并不清楚并不相同人群之前酵母菌多样性的差异和变化上述情况。

原始出处:

Alexandre Almeida, Stephen Nayfach, Miguel Boland, et al.A unified catalog of 204,938 reference genomes from the human gut microbiome.Nat Biotechnol. 2020 Jul 20. doi: 10.1038/s41587-020-0603-3.

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